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真菌毒素檢測方法一般是采用酶聯免疫檢測技術，適用于標準檢測試劑盒進行定性定量檢測。主要用于檢測各種飼料、飼料原材料、乳制品、油脂等樣品中B1、M1、玉米赤霉烯酮、嘔吐毒素、T2毒素、赭曲霉毒素等真菌毒素的含量。
真菌毒素的檢測方法有哪些：
1、薄層層析法：
薄層層析法是針對不同的樣品，用適宜的提取溶劑將霉菌毒素從樣品中提取出來，經柱層析凈化，再在薄層板上層析展開、分離，利用霉菌毒素的熒光性，根據熒光斑點的強弱與標準比較測定其含量。薄層層析法樣品前處理繁瑣，且提取和凈化效果不夠理想，提取液中雜質較多，在展開時影響斑點的熒光強度。
2、色譜法：
色譜法，包括薄層色譜、氣相色譜、液相色譜等，一直是重要的真菌毒素的化學分析方法。現在比較普遍的真菌毒素的分析方法還是液相色譜法，包括液相色譜-質譜聯用技術。該法快速而準確，但需要昂貴的儀器設備，僅限于專業檢測機構獲得科研和調查分析、監測使用，未能在企業及基層廣泛推廣使用，而且其結果的滯后效應大大降低了對生產實際的指導效果。
3、免疫化學檢測法： （膠體金免疫層析法，酶聯免疫吸附法）
免疫學檢測方法是基于抗體與抗原或半抗原之間的選擇性反應而建立起來的一種生物化學分析法。通常具有高的選擇性和很低的檢出限，廣泛用于各種抗原、半抗或抗體的測定，一般可分為熒光免疫法、發光免疫法、免疫法及電化學免疫法等非放射免疫法和放射免疫法，其中在飼料霉菌毒素檢測中應用較廣的主要是酶聯免疫吸附法和膠體金免疫層析法。
糧食真菌毒素檢測儀由于其快速、靈敏、準確、可定量、操作簡便、無需貴重儀器設備，且對樣品純度要求不高等特性，適用于飼料廠、糧油/食品加工廠、養殖場等企業進行原料或成品的檢測以及工商質監部門現場檢測。
